L’intestin fait partie du tube digestif. Il remplit un rôle majeur dans la digestion et l’assimilation des nutriments. Il se compose de 2 parties : l’intestin grêle et le gros intestin. C’est le lieu de passage des nutriments vers le sang et le reste de l’organisme. La fine membrane de l’intestin grêle est recouverte de plis et de villosités pour augmenter sa surface et permettre un nombre important d’échanges avec le réseau sanguin. Il forme une barrière qui empêche l’entrée de pathogène. Dans sa lumière, il y a le microbiote composé de bactéries et autres micro-organismes. Le tissu lymphoïde associé au tube digestif est le principal support du système immunitaire, il protège l’organisme des invasions. C’est un lieu de stockage des lymphocytes B et T.
Dans le gros intestin, les bactéries décomposent les molécules non assimilables au niveau de l’intestin grêle comme les fibres. C’est le lieu de synthèse des vitamines B et K.